时间: 2019-01-31  李进

申铁

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姓名:申铁  学历:博士

地域:贵州省内博士  专业:其他


申铁博士简介

申铁,男,1982年生,师从著名生物物理家中国科学院施蕴渝院士学习工作,于中国科大微尺度物质科学国家实验室bio-x分部获生物学博士学位,曾在美国Rutgers Univeristy的Waksman研究所和中国科学院上海生命科学院进行博士后工作,现为贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室副教授,硕士生导师。

学术称号:贵州省高层次创新人才“千”层次计划

学术兼职:贵州古茶树保护与利用专业委员会专家委员

                  贵州省茶文化研究会副秘书长

研究方向和兴趣:贵州省经济作物和特色微生物的生物大数据

1. 基因组学

2. 代谢流量组学

3. 多维全基因组关联分析

工作经历:

2017年3月至2018年10月 美国罗格斯大学          博士后研究

2011年12月至今        贵州师范大学                副教授,硕士生导师

2011年7月2011年11月  贵州省烟草科学研究院                助理研究员

2010年7月至2011年6月  中科院上海植物生理生态研究所      博士后研究

教育背景:

2004年9月至2010年6月  中国科技大学生命科学学院          免试硕博连读

2000年9月至2004年6月  中国科技大学生命科学学院                  本科

项目经验:

1.国家自然科学基金地区项目(主持):31760254,基于超图的基因组规模代谢网络比对方法研究

2.国家自然科学基金地区项目(主持):31460233,大肠杆菌超氧化应激时赖氨酸乙酰化修饰网络的化学热动力学状态对中心碳代谢系统的调控作用

3.国家自然科学基金青年项目(主持):31200626,代谢流和代谢物组技术研究大肠杆菌中心碳代谢系统氧化应激适应时的动力学过程和稳态机制

4.贵州省科技基金(主持):黔科合J字LKS[2015]7773号,多级调控通路对大肠杆菌超氧化应激时代谢系统应答的调控机制研究

5.贵州省科技基金(主持):黔科合J字LKS[2012]22号,大肠杆菌碳代谢系统氧化应激时的动力学过程和稳态机制

近期主要论著 (*共通讯作者, †共第一作者):

1、Tie Shen†,*, Zhengdong Zhang†, Zhen Chen†, Dagang Gu, Shen Liang, Yang Xu, Ruiyuan Li, Yimin Wei, Zhijie Liu,Yin Yi* & Xiaoyao Xie*. A genome-scale metabolic network alignment method within a hypergraph-based framework using a rotational tensor-vector product. Scientific Reports (2018) 8:16376,DOI:10.1038/s41598-018-34692-1

2、Bin Rui, Tie Shen*, Han Wen* (2015) Interpretation and integration of 13C-fluxomics data. Metabolomics: Open Access.

3、Zhengdong Zhang†,Tie Shen†, Bin Rui†,Chenwe Xin,Wenwei Zhou, Xiangfei Zhou, Chuanyu Shang, Ruiyuan Li,Shanping You,Gang Li, Mengshu Han, Yin Yi, Zhijie Liu*,Han Wen* and Xiaoyao Xie*.CeCaFDB: a curated database for the documentation,visualization and comparative analysis of Central Carbon metabolic Flux Distributions explored by 13C-fluxomics. Nucleic Acids Research, 2015, 43(D1): D549–D5573. (SCI,IF:9.20)

4、Bin Rui†,Yin Yi†, Tie Shen,Meijuan Zheng; ,Zhengdong Zhang,Zhijie Liu; Shengsheng Xu; Han Wen; Xiaoyao Xie.Elementary flux mode analysis revealed cyclization pathway as a powerful way for NADPH regeneration of central carbon metabolism. Plos ONE 10(6): e0129837. doi:10.1371/journal.pone.0129837  ( SCI,IF:3.52)

5、Tie Shen, Bin Rui, Hong Zhou, Ximing Zhang, Yin Yi, Han Wen, Haoran Zheng, Jihui Wu and Yunyu Shi (2013) Metabolic flux ratio analysis and multi-objective optimization revealed a globally conserved and coordinated metabolic response of E. coli to paraquat-induced oxidative stress Molecular BioSystems 9(1):121-32. (SCI,IF:3.55)

6、Bin Rui, Tie Shen, Hong Zhou, Jianping Liu, Jiusheng Chen, Xiaosong Pan, Hanyan Liu, Jihui Wu, Haoran Zheng and Yunyu Shi. (2010) A systematic investigation of Escherichia coli central carbon metabolism in response to superoxide stress. BMC Systems Biology  4:122(SCI,IF:3.15)

7、Tie Shen*, Weiqun Shen, Ying Xiong, Haiyan Liu, Haoran Zheng, Hong Zhou, Bin Rui, Jianping Liu, Jihui Wu, Yunyu Shi*. (2009)“Increasing the accuracy of mass isotopomer analysis through calibration curves constructed using biologically synthesized compounds.” Journal of Mass Spectrometry  44(7):1066-80. (SCI,IF:3.43)

8、Hong Zhou, Haoran Zheng, Tie Shen, Bin Rui. “Flux Balance Analysis Within Physiologically Feasible Region.” (2009). 3rd International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering  pp. 1-4. (EI)

9、Jiusheng Chen, Haoran Zheng , Haiyan Liu, Junqing Niu, Jianping Liu, Tie Shen, Bin Rui and Yunyu Shi. (2007). “Improving metabolic flux estimation via evolutionary optimization for convex solution space.”Bioinformatics. 23(9):1115-1123 (SCI,IF:4.29).

10、申铁. 2010. 中国科学技术大学博士学位论文.《13C代谢通量分析平台的建立和改良》。

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